Ka ukusnijem paradajzu: Vraćanje izgubljene STP1 varijante u modernom paradajzu

Ka ukusnijem paradajzu: Vraćanje izgubljene STP1 varijante u modernom paradajzu

U studiji koja je nedavno objavljena u časopisu Horticulture Research, istraživači su izvršili studiju asocijacije na genomu (GVAS) za SSC crveno zrelih plodova u populaciji koja se sastoji od 481 akcesije paradajza sa velikim prirodnim varijacijama i pronašli su novi kvantitativni lokus osobina, STP1, koji kodira protein transportera šećera.

Uzročna varijacija STP1, InDel od 21 bp, koji se nalazi u promotorskom regionu 1,124 bp uzvodno od startnog kodona, menja njegovu ekspresiju. STP1 Insertion pristupi sa umetanjem 21-bp imaju veći SSC od pristupa STP1 Deletion sa brisanjem od 21-bp.

Nokautiranje STP1 u TS-23 sa visokim SSC korišćenjem CRISPR/Cas9 značajno je smanjilo SSC u plodovima. In vivo i in vitro testovi su pokazali da ZAT10-LIKE, faktor transkripcije proteina cinkovog prsta (ZFP TF), može specifično da se veže za promoter STP1 Insercije da bi poboljšao ekspresiju STP1, ali ne i za promoter STP1 Delecije, što dovodi do nižeg SSC ploda u modernom paradajzu . Analiza diverziteta otkrila je da je STP1 odabran tokom poboljšanja paradajza.

Autori su identifikovali prirodnu uzročnu varijaciju koja je u osnovi SSC u paradajzu i novu ulogu ZFP TF-a u regulisanju transportera šećera. Nalazi obogaćuju razumevanje evolucije i pripitomljavanja paradajza i pružaju genetsku osnovu za uzgoj ukusnog paradajza.