Nedavno otkriće Ug99 soja rđe pšeničnog stabla u Nepalu, objavljeno u časopisu Plant Disease, skrenulo je pažnju na potrebu za zaštitom pšenice, trećeg najvažnijeg useva u Nepalu, od ozbiljnih izbijanja ove destruktivne bolesti. Nepal se suočava s čestim epidemijama uzrokovanim sličnim patogenima, poput žute rđe, koje mogu prouzrokovati značajne gubitke prinosa ako se ne kontrolišu efikasno. Identifikacija tačnog soja patogena prisutnog na poljima je ključna za uspešno vođenje mera kontrole.
Uvođenje MARPLE dijagnostike u Nepalu od 2022. godine za borbu protiv žute rđe pokazalo se korisnim. Ova dijagnostička metoda, razvijena u saradnji sa CIMMIT-om, omogućava analizu uzoraka pšenice zaražene žutom rđom korišćenjem MinION nanopore sekvencera. Identifikacija genomske strukture različitih sojeva patogena omogućava brzu detekciju prisutnih sojeva u regionu.
Ovaj mobilni pristup genotipizaciji omogućava identifikaciju sojeva patogena na licu mesta bez potrebe za složenom opremom. Takođe, pruža informacije o nivou sojeva u roku od 48 sati, što je od vitalnog značaja za hitne situacije. Proširenje metode za identifikaciju sojeva patogena rđe stabljike omogućava efikasno praćenje sojeva poput Ug99 u realnom vremenu.
Suraj Baidia, viši naučnik iz Nacionalnog istraživačkog centra za patologiju biljaka u Nepalu, ističe značaj MARPLE dijagnostike za brzu identifikaciju i upravljanje raznolikošću patogena rđe. Doktor Ram Khadka je uspešno testirao MARPLE platformu za rđanje stabljike u NARC-u, identifikujući novi soj rđe u Nepalu, Clade IV, što je potvrđeno rezultatima iz Globalnog referentnog centra za rđu u Danskoj.
Profesor Diane Saunders ističe važnost pristupa inovacijama u dijagnostici biljnih bolesti kako bi se podržale borbe protiv razornih bolesti. Profesor David Hughes komentariše mogućnosti brze kontrole uz pomoć genetskih testova poput MARPLE i platforme PlantVillage. Dr Dejv Hodson najavljuje korišćenje MARPLE dijagnostike za praćenje širenja Ug99 soja i drugih patogenih sojeva kako bi se suzbila pretnja rđe pšenice u Nepalu.
