Cilijati, grupa jednoćelijskih eukariota sa trepavicama, proučavani su od početka svetlosne mikroskopije, sa više od 10.000 opisanih vrsta. Cilije su ključna karakteristika cilijata i doprinose njihovoj raznolikosti. Razlikuju se po dužini, pokrivaju površinu ćelije ili određene delove, ili se mogu spajati u snopove da formiraju ciri. Bojenje cilija i bazalnih tela je uobičajena procedura u istraživanju morfologije trepavica, koristeći tehnike kao što su impregnacija srebrom i imunofluorescentno bojenje sa antitelima povezanim sa tubulinom.
Tubulinske boje živih ćelija, koje se obično koriste u ljudskim ćelijama, zahtevaju reagense za permeabilizaciju ćelija da bi ušli u ćelije. Međutim, ovi reagensi su neefikasni kod cilijata. U ćelijama trepavica, boje se obično unose fagocitozom i završavaju u organelama zatvorenim membranom, što predstavlja izazov za isporuku boja.
U studiji objavljenoj u časopisu Vodena biologija i bezbednost, tim istraživača iz Kine razvio je jednostavnu i prilagodljivu metodu za bojenje tubulina/cilija koja daje odlične rezultate kod cilijata.
„Naš metod podrazumeva korišćenje tubulinskih boja živih ćelija za bojenje fiksnih ćelija trepavica, što predstavlja veoma efikasnu i praktičnu opciju za istraživanje trepavica“, kaže glavni autor Tingting Pan. „Štaviše, omogućava besprekornu integraciju imunofluorescentnog bojenja sa antitelima kada je to potrebno.
Ova nova metoda bojenja tubulina nudi istraživačkoj zajednici cilijata četiri značajne prednosti.
„Fleksibilnost metode omogućava bojenje mešovitih ćelijskih populacija iz vodenih sredina, naknadno obogaćivanje pomoću planktonske mreže“, dodaje Pan. „Kako napreduje visoko propusno fluorescentno snimanje, naš metod bojenja mogao bi se neprimetno integrisati sa sistemima klasifikacije zasnovanim na mašinskom učenju zbog svog kapaciteta za slike sa jasnom pozadinom.