Novi istraživački rad pod nazivom „Transkriptomska analiza identifikuje četiri nova receptora koji potencijalno povezuju rak endometrijuma sa sindromom policističnih jajnika i generiše transkriptomski atlas objavljen je u Oncotargetu.
Sindrom policističnih jajnika (PCOS) je povezan sa 3 do 4 puta povećanim rizikom od raka endometrijuma (EC), ali molekularni mehanizmi su nejasni. Povećanje regulacije IGF1 gena u endometrijumu PCOS može povećati rizik od EK, ali to je neizvesno. U ovoj novoj studiji, istraživači Fatma Alkutami, Mahmood Hachim, Charlie Hodgman i Villiam Atiomo sa Univerziteta za medicinu i zdravstvene nauke Mohamed Bin Rashid i Univerziteta u Notingemu imali su za cilj da istraže veze između EC i PCOS, analizirajući javno dostupne transkriptomske podatke.
„Prvobitni cilj ove studije bio je da se ispitaju veze između EC i PCOS, analizom javno dostupnih transkriptomskih podataka i istraživanjem ekspresije gena IGF-1 i IGFBP u endometrijumu žena sa PCOS i EC u poređenju sa normalnim endometrijumom“, objašnjavaju istraživači.
NCBI Gene Ekpression Omnibus je korišćen za identifikaciju relevantnih studija. Diferencijalno izraženi geni (DEG) su identifikovani i analizirani korišćenjem Metascape-a da bi se identifikovali putevi od interesa. PCOS DEG koji kodiraju proteine izlučene u krv identifikovani su korišćenjem baze podataka o proteinima krvi Atlasa ljudskih proteina.
EC DEG koji su ćelijski receptori identifikovani su korišćenjem EcoTiper-a. Oni su ukršteni da bi se identifikovalo koji EC receptori stupaju u interakciju sa proteinima koje luče PCOS. U EC je identifikovano sedam receptora, ali su samo geni PTPRF, ITGA2, ITGA3 i ITGB4 eksprimirani na epitelnim ćelijama. Obogaćivanje ovih gena pokazalo je da je glavni i uobičajeni put uključen u signalni put PI3K-AKT koji je bio u skladu sa vezom između PCOS i EC. Međutim, IGF1 je bio smanjen u PCOS i EC.
„Naši zaključci u ovoj fazi ne podržavaju vezu između IGF-1 i IGFBP gena u PCOS-u i EC-u. Međutim, identifikovali smo četiri nova receptora koji mogu biti podloga rizika od EC-a kod PCOS-a, i verujemo da naši nalazi pružaju dovoljno dokaza za čine osnovu za transkriptomski atlas koji će podržati buduća istraživanja veza između PCOS i EC i molekularnih mehanizama koji podupiru obe bolesti“, zaključuju istraživači.
