Studija naglašava važnost genetskog sekvenciranja za dijagnozu poremećaja rasta

Studija naglašava važnost genetskog sekvenciranja za dijagnozu poremećaja rasta

U članku objavljenom u Journal of Pediatrics, istraživači sa sedištem u Brazilu opisuju slučaj devetogodišnjeg dečaka primljenog u bolnicu sa više simptoma i preklapajućim stanjima koja su otežala dijagnozu, kao što je nizak rast, tanka zubna gleđ (hipoplazija zubne gleđi), umereni mentalni nedostatak, kašnjenje u govoru, astma, blago izmenjen nivo šećera u krvi i istorija ponavljajućih infekcija u detinjstvu.

Tim je koristio sekvenciranje egzoma, u kojem se analizira samo deo genoma koji kodira protein, da bi potražio genetske mutacije i pronašao ih u GCK i BCL11B. Dijagnoza je bila monogeni dijabetes i sindrom abnormalnosti T-ćelija, oboje su retke bolesti. Identifikacija tačnog uzroka problema i otkrivanje promene šećera u krvi značajno su uticali na njihov izbor lečenja.

Ovo je jedan od šest slučajeva koji uključuju sindromske poremećaje rasta sa višestrukim genetskim dijagnozama (dva ili više različitih genetskih stanja kod istog pacijenta) opisanih u članku, a koji se tiče studije koju su sproveli istraživači na Medicinskom fakultetu Univerziteta u Sao Paulu (FM-USP). ).

„Sekvenciranje egzoma je veoma korisna tehnologija za smanjenje onoga što nazivamo dijagnostičkom odisejom — dug put koji pacijenti sa retkim ili složenim stanjima moraju da prođu dok ne dobiju odgovarajuću dijagnozu. Pre deset godina, privatne laboratorije su naplaćivale 10.000 BRL. Cena je sada pao je na 4.000 BRL (oko 800 USD). To je još uvek mnogo novca za test, ali se pokazalo neophodnim za tačnu dijagnozu i lečenje u slučajevima ove vrste“, rekao je Aleksandar Augusto de Lima Horhe, poslednji autor članka.

Tim je sekvencirao egzome 115 pacijenata sa sindromskim poremećajima rasta koji su imali do sada nepoznate uzroke, dijagnostikujući 63 na osnovu genetske analize; 9,5% njih imalo je višestruku dijagnozu, daleko više nego u prethodnim studijama.

„Slučajevi su uključivali dva ili više retkih monogenskih stanja kod istog pacijenta. Takve slučajeve je veoma teško dijagnostikovati, posebno samo kliničkom procenom. Studija naglašava potrebu da se koriste široki genetski testovi kao što su celi egzom ili sekvenciranje celog genoma za ove pacijente kao jedini način da se identifikuju retke bolesti koje objašnjavaju takve grupe stanja“, rekao je Lima Horhe.

Postoje brojne retke bolesti, uključujući poremećaje rasta, tako da je prirodno teško identifikovati mnoge od njih, dodao je on. Veruje se da između 5% i 10% svetske populacije ima retku bolest.

Nizak ili visok rast nije dijagnoza već klinički nalaz.

„Nizak rast može imati spoljni uzrok, kao što je infekcija ili neuhranjenost. Čak i tako, genetski faktori će uvek biti važni za rast“, rekla je Lima Horhe.

„Kod zdrave dece sa niskim ili visokim rastom kao jedinom manifestacijom, verovatno će postojati poligenska osnova [gde na rast utiče nekoliko genetskih varijanti], ali kod sindromskih poremećaja rasta, kod kojih je nizak ili visok rast praćen drugim nalazima kao što su kao mentalni nedostatak, gluvoća, poremećaj autističnog spektra ili malformacija, verovatnija je promena u jednom ili više gena kao opravdanje za složeni fenotip koji je uključen.“

U svetlu rezultata, istraživači se zalažu za prepoznavanje višestrukih genetskih dijagnoza kao mogućnosti u složenim slučajevima poremećaja rasta, otvarajući nove izglede za lečenje i genetsko savetovanje za takve pacijente, umesto tipične paradigme koja zahteva jedinstvenu dijagnozu. objasni sve nalaze.

U članku, istraživači navode da je razvoj tehnika sekvenciranja sledeće generacije, kao što je sekvenciranje celog egzoma ili celog genoma, učinio da odabir jednog gena kao kandidata za objašnjenje slučaja nije potreban. Ova posebna korist se pokazala korisnom u istraživačkom okruženju za podsticanje otkrivanja novih gena povezanih sa bolestima, za dalje proučavanje stanja sa visokim stepenom genetske heterogenosti i za pomoć u brizi za pacijente sa složenim sindromskim stanjima, gde se dijagnoze ne mogu postaviti. dobijene tradicionalnim kliničkim i genetskim metodama.

Nekoliko izazova koje je primetila Lima Jorge uključuju visoku cenu genetskih testova i činjenicu da sekvenciranje egzoma ima stopu uspeha od oko 50% u dijagnozi složenih slučajeva. Drugim rečima, oko polovine pacijenata podvrgnutih ovoj vrsti analize moraće da nastavi da traži konačnu dijagnozu.