Istraživači su postigli značajan napredak u razumevanju DNK topoizomeraze tipa II, enzima kodiranog virusom afričke svinjske kuge (ASFV), što bi moglo pružiti ključne smernice za razvoj novih lekova protiv ove devastirajuće bolesti. Ova otkrića su objavljena u prestižnom časopisu Nature Communications 30. maja.
Virus afričke svinjske kuge je jedini poznati infektivni virus sisara koji kodira DNK topoizomerazu tipa II, enzim ključan za upravljanje strukturom DNK tokom replikacije i transkripcije. Dosadašnji nedostatak sigurnih i efikasnih vakcina i lekova dodatno naglašava potrebu za dubljim razumevanjem ovog virusa kako bi se suzbila globalna pretnja koju predstavlja za svinjsku industriju.
Na čelu sa profesorom [ime profesora], tim istraživača je izveo opsežne biohemijske eksperimente kako bi istražio konformacionu dinamiku pP1192R, DNK topoizomeraze tipa II kodirane virusom afričke svinjske kuge, u kompleksu sa nukleinskim kiselinama. Korišćenjem ovih eksperimenata, potvrđena je enzimatska aktivnost pP1192R in vitro.
Studija je otkrila strukture visoke rezolucije tri različite konformacije pP1192R proteina u apo stanju, ukazujući na različite pravce otvaranja centralnog strukturnog domena proteina. Istraživači su prevazišli izazov nestabilnosti N-terminalnog domena ATPaze dodavanjem specifičnih molekula nukleinske kiseline i, nakon optimizacije uzorka, uspeli su da uhvate strukturu proteinskog kompleksa pune dužine vezanog za linearnu DNK.
Analiza strukture pokazala je značajno savijanje dvolančane DNK, koje je izazvalo prelazak iz „B-forme“ u „A-formu“. Korišćenjem mikroskopije atomske sile, istraživači su direktno posmatrali ukrštanje plazmida i DNK koja se vezuje za protein, potvrđujući ovu osobinu vezivanja. Kroz molekularno spajanje, identifikovana su dva različita tipa inhibitora DNK topoizomeraze tipa II kao potencijalne početne tačke za dizajn lekova.
Ova studija detaljno objašnjava strukturu i funkciju virusno kodirane DNK topoizomeraze tipa II koristeći različite eksperimentalne tehnike, otkrivajući molekularni mehanizam ovog enzima. Otkrića pružaju teorijsku osnovu za razvoj strategija za prevenciju i kontrolu afričke svinjske kuge, nudeći potencijalne strategije intervencije za smanjenje uticaja ovog virusa.
Rezultati istraživanja predstavljaju veliki korak napred u borbi protiv afričke svinjske kuge, dajući nadu za razvoj efikasnih terapija koje bi mogle značajno smanjiti štetu koju ovaj virus nanosi svinjskoj industriji širom sveta.
