Korišćenje enzima za modifikaciju genoma RNK virusa

Korišćenje enzima za modifikaciju genoma RNK virusa

Tim mikrobiologa sa Državnog univerziteta Montana razvio je način da koristi enzim za rezanje i enzim za popravku RNK za modifikovanje genoma RNK virusa. Oni opisuju svoju tehniku u Science Advances.

Tokom protekle decenije, razvijeni su alati za uređivanje gena sa grupisanim, redovno raspoređenim kratkim palindromskim ponavljanjima (CRISPR), koji omogućavaju uređivanje DNK. Proces funkcioniše tako što se RNK sekvence koriste za pronalaženje željene mete u lancu DNK, a zatim se koristi određena vrsta proteina za presecanje sekvence. Sistem je razvijen nakon otkrića da ga bakterije i arheje koriste za uređivanje DNK virusnih neprijatelja.

U skorije vreme, naučnici su pokušavali da koriste istu ili sličnu tehniku za uređivanje RNK. Većina aktuelnih pristupa uključuje transkripciju RNK u DNK, uređivanje, a zatim njihovu transkripciju nazad u RNK. Istraživači iz države Montana tražili su direktniji pristup.

Novi pristup uključuje upotrebu CRISPR sistema tipa III preuzetog iz Streptococcus thermophilus, vrste bakterije koja se nalazi u mlečnim proizvodima. Koristi se za pronalaženje mesta u ciljnoj RNK gde je sečenje poželjno. Kada se meta preseče, DNK udlage se koriste za povlačenje visećih niti zajedno, gde se ponovo spajaju pomoću enzima virusne ligaze.

Da bi testirao svoj proces, tim je napravio željena brisanja u RNK virusa Sindbis. Izabran je zato što ima zeleni fluorescentni segment u svojoj RNK. Odsecanje je omogućilo virusu da preživi, ali više nije bio fluorescentan.

Istraživački tim sugeriše da bi se njihova tehnika, ili druge slične njoj, mogle koristiti za sprovođenje istraživanja RNK, posebno onih koji uključuju dobijanje ili gubitak funkcije kod virusa, kao što je virulencija. Napominju da bi se takođe mogao koristiti za uklanjanje funkcija u virusu koje mu omogućavaju da zaobiđe lekove koji se koriste da ga ubiju. Oni takođe ističu da mogućnost uređivanja RNK otvara vrata novim vrstama terapija za lečenje poremećaja zasnovanih na RNK.