Dr Pierre Billon, Ph.D., bio je frustriran vremenom koje je bilo potrebno da se genetska analiza uradi u specijalizovanim privatnim laboratorijama. Rezultati DNK uzoraka koji su mu bili potrebni za njegovo istraživanje nisu bili dostupni nedeljama, a ponekad i mesecima. Eksternalizacija objekata za genom je takođe bila skupa.
Bilon je bio uveren da postoji još jedan pristup koji može da pruži rezultate brže i na isplativiji način. Uz pomoć njegovog istraživačkog saradnika Lua Bodriera i gostujućeg studenta istraživača, Orlene Benamozig, osmislili su i pokazali način da to urade.
„Razvili smo metod koji je toliko jednostavan za implementaciju i upotrebu da svaka laboratorija, bilo gde u svetu, može lako da uspostavi sopstveni komplet, kako bi postigla analizu genetskih mutacija istog dana za nekoliko centi po uzorku“, kaže Bilon, docent na Cumming School of Medicine (CSM). „Zaista smo uzbuđeni zbog mogućnosti našeg domaćeg sistema i njegove svestranosti za različite primene u kliničkom okruženju.“
Sistem, nazvan One-pot DTECT, je kompaktan komplet koji sadrži više enzima i jedinstvene DNK fragmente koji otkrivaju i detektuju genetske potpise. Genetski podaci se mogu analizirati na tri načina: kvantitativno, kvalitativno i vizuelno.
„DTECT u jednom loncu može potvrditi prisustvo varijanti i precizno odrediti učestalost ovih mutacija“, kaže Billon. „Tačno otkrivanje genomskih sekvenci i njihovih mutacija je kritično za različite primene u istraživačkim i kliničkim okruženjima.
Da bi pokazali tačnost u kliničkom kontekstu, istraživači su kontaktirali dr Nicolu Vright, BSc ’94, MD ’97, pedijatrijskog hematologa i imunologa u dečjoj bolnici Alberta. Jedna od oblasti Rajtove ekspertize su poremećaji krvi, kao što je anemija srpastih ćelija, koja je uzrokovana genetskim mutacijama.
Da bi testirali da li One-pot DTECT može biti efikasan kao brza dijagnostička alatka, istraživači su sproveli slepo istraživanje. U njemu je učestvovala 21 osoba: pacijenti sa anemijom srpastih ćelija, ljudi koji su nosioci mutacije, ali nemaju to stanje, i kontrole, ljudi bez mutacije. Rezultati, otkriveni istog dana, bili su ono čemu su se istraživači nadali.
„Naš komplet je identifikovao različite genetske potpise i jasno razlikovao pogođene pojedince od nosilaca i kontrola sa 100 odsto tačnošću i nula procenata lažno pozitivnih ili lažno negativnih“, kaže Bilon.
Istraživači su takođe potvrdili da se komplet može koristiti na malim količinama DNK, poput krvnih mrlja.
„Ovo ima važnu primenu za dijagnostikovanje novorođenčadi i male dece jer može biti teško prikupiti krv od dece“, kaže Rajt, katedra Barb Ibotson u pedijatrijskoj hematologiji. „Krvne mrlje je lakše dobiti, a rana i precizna dijagnoza je ključna za pokretanje odgovarajuće strategije lečenja i lečenja“,
Bilon dodaje. Komplet se može koristiti za dijagnostikovanje širokog spektra genetskih mutacija za krvne i druge poremećaje, uključujući cističnu fibrozu. Dodatni detalji o metodama koje se koriste za testiranje One-pot DTECT su objavljeni u Cell Reports Methods.
Bilon, Baudrier i Benamozig imaju patentnu prijavu u procesu preko Innovate Calgari, univerzitetskog centra za prenos znanja i biznis inkubatora, koji se aktivno sarađuje sa industrijskim partnerima za licenciranje One-pot DTECT kako bi ga učinio dostupnim naučnicima, kliničarima i pacijentima kome treba. Bilon je razvio originalnu verziju One-pot DTECT dok je bio postdoktor na Univerzitetu Kolumbija u Njujorku. Tamo su podneli prvu prijavu patenta.
