Naučnici su razvili novi način za brzu dijagnostiku bakterijskih infekcija kod pasa, omogućavajući testiranje i lečenje odgovarajućim antibioticima istog dana.
Metoda bi mogla da eliminiše kašnjenja povezana sa konvencionalnom dijagnozom, u kojoj se uzorak mora kultivisati danima da bi se identifikovale prisutne bakterije pre nego što se prepiše odgovarajući tretman.
To je značajan korak ka odgovarajućoj upotrebi antibiotika ograničavanjem upotrebe neodgovarajućih ili širokog spektra antibiotika za neidentifikovane infekcije i sprečavanjem dugih tokova lečenja.
Razvoj bi se takođe mogao primeniti na medicinu životinja i ljudi, za bakterijske i druge vrste infekcija, kažu istraživači.
Tim je koristio komplete optimizovane za uobičajene bakterijske vrste kako bi im omogućio da izvuku svu DNK iz uzorka bez prethodnog znanja o tome koje vrste su prisutne – takozvana metagenomska ekstrakcija DNK.
Oni su ovo kombinovali sa postojećom tehnologijom koja generiše DNK kod iz uzoraka, poznatom kao sekvenciranje nanopora, i alatom za analizu podataka koji identifikuje bakterije prema njihovom DNK otisku prsta.
Ovaj pristup omogućava identifikaciju bakterija u realnom vremenu, omogućavajući rezultate za nekoliko sati.
Geni identifikovani u uzorku takođe daju dragocen uvid u to kako će prisutne bakterije verovatno reagovati na lečenje antibiotikom, omogućavajući kliničarima da prepišu lek koji je najpogodniji za infekciju.
Tim je testirao svoj sistem sa kožnim i urinarnim bakterijskim infekcijama kod pasa i uspeo je da otkrije bakterije u roku od pet sati.
Bili su u stanju da identifikuju bakterijske vrste koje je teško identifikovati konvencionalnim uzgojem i sa velikom osetljivošću utvrditi da li su prisutne bakterije verovatno otporne na antibiotike.
Sistem je dizajniran da bude prilagodljiv za upotrebu u različitim uzorcima i infekcijama različitih životinjskih vrsta.
U budućnosti bi mogao biti koristan u nizu infekcija životinja i ljudi, potencijalno pomoći u dijagnozi i lečenju drugih vrsta infekcija uzrokovanih virusima i parazitima, kažu istraživači. Studija je objavljena u Microbial Genomics.
„Naš metod nudi brz način za dijagnostikovanje bakterijskih infekcija i prepisivanje odgovarajućih antibiotika u roku od nekoliko sati od testiranja pacijenata. Nakon našeg rada na infekcijama kože i urinarnog trakta kod pasa, uvereni smo da ovaj pristup ima potencijal za upotrebu kod mnogih životinjskih vrsta, kao i kod ljudi , i ima primenu u drugim tipovima infekcija. Mogao bi da igra značajnu ulogu u omogućavanju odgovorne upotrebe antimikrobnih tretmana i ograničavanju antimikrobne rezistencije“, kaže dr Natali Ring.
