Istraživači iz Janelia Research Campusa razvili su Cellpose3, naprednu verziju popularnog softverskog alata za analizu mikroskopskih slika, koja omogućava precizno prepoznavanje pojedinačnih ćelija čak i na iskrivljenim, zamagljenim ili bučnim snimcima.
Prethodne metode segmentacije, uključujući ranije verzije Cellpose-a, često su imale problema s definisanjem granica ćelija kada su slike bile niske kvalitete. Da bi rešili ovaj problem, Carsen Stringer i Marius Pachitariu razvili su novi algoritam koji ne pokušava da poboljša samu sliku, već direktno unapređuje sposobnost prepoznavanja ćelijskih granica.
Cellpose3 koristi algoritam za restauraciju slika, koji prvo rekonstruiše oštriju verziju originalne slike, a zatim primenjuje poboljšane metode segmentacije. Ovaj pristup omogućava precizno izdvajanje pojedinačnih ćelija čak i u najizazovnijim uslovima mikroskopskog snimanja.
Softver je treniran na velikoj i raznovrsnoj bazi mikroskopskih slika, što ga čini univerzalno primenjivim bez potrebe za dodatnim podešavanjem. Cellpose3 sada dolazi s opcionom funkcijom „jednim klikom”, omogućavajući korisnicima da automatski poboljšaju segmentaciju svojih podataka bez složenih prilagođavanja.
Studija koja opisuje ovu tehnologiju objavljena je u prestižnom časopisu Nature Methods, a Cellpose3 je već dostupan istraživačima širom sveta. Očekuje se da će značajno unaprediti obradu mikroskopskih podataka u biološkim i medicinskim istraživanjima.
