Nedavna studija razvila je novu metodu za analizu genetskih varijacija u porodicama sa visokom incidencom raka dojke. Ispitivanjem 1.218 genetskih varijanti u 12 porodica, istraživanje je identifikovalo 80 gena povezanih sa povećanim rizikom od bolesti. Takođe je istakla značajnu — ali ranije zanemarenu — ulogu peroksizomalnih i mitohondrijalnih puteva u predispoziciji za rak dojke i preživljavanju pacijenata.
Rak dojke je najčešći malignitet među zapadnim ženama, sa do 10% slučajeva koji se pripisuju genetskim varijantama. Uprkos tome, koreni mnogih porodičnih slučajeva ostaju neistraženi, uglavnom zbog složene prirode uključenih genetskih faktora.
Rešavajući ovu kritičnu prazninu, nedavna studija koju je vodila prof. Dina Šnajdman-Duhovni sa Rachel i Selim Benin škole računarskih nauka i inženjerstva na Hebrejskom univerzitetu u Jerusalimu pružila je nove uvide u genetske osnove porodičnog raka dojke, posebno rasprostranjenog u porodice bliskoistočnog porekla.
Rad je objavljen u časopisu Briefings in Bioinformatics .
Studija koristi inovativni metod analize prilagođen za ispitivanje genetskih varijacija u porodicama sa istorijom raka dojke. Ovaj metod kombinuje najsavremenije mašinsko učenje sa detaljnom analizom proteinskih struktura da bi se istražile retke genetske varijante.
Ispitivanjem 1.218 varijanti pronađenih među članovima 12 porodica, istraživači su identifikovali 80 gena koji bi mogli značajno uticati na rizik od raka dojke. Ovo otkriće uključuje 70 gena za koje se ranije nije znalo da su povezani sa rakom dojke, značajno proširujući naše razumevanje genetskog pejzaža bolesti.
Nasledni ili porodični rak dojke čini oko 15% svih slučajeva raka dojke. Istorijski gledano, mutacije u dobro poznatim genima kao što su BRCA1 i BRCA2 bile su povezane sa povećanim rizikom od porodičnog raka dojke i jajnika. Ipak, oni čine samo oko 30% -40% slučajeva porodičnog raka dojke. Ovo ostavlja značajan broj slučajeva nepoznatog genetskog porekla, posebno u porodicama u kojima je bolest očigledna kroz generacije.
Studija je otkrila ključne uloge za određene ćelijske puteve povezane sa peroksizomima i mitohondrijama u predisponiranju pojedinaca na rak dojke i uticaju na preživljavanje pacijenata. Utvrđeno je da su ovi putevi posebno značajni u različitim etničkim grupama u sedam proučavanih porodica, naglašavajući širu primenljivost i važnost nalaza.
Istraživači su koristili kompletno sekvenciranje genoma i analizu veštačke inteligencije da bi proučavali genetske varijacije kod žena iz bliskoistočnih porodica. Ovaj pristup je identifikovao značajne genetske promene, povezujući podgrupe gena sa kritičnim ćelijskim putevima koji uključuju peroksizome, koji igraju ključnu ulogu u metabolizmu masti.
Prof. Schneidman-Duhovni je primetio: „Naše istraživanje ne samo da baca svetlo na neuhvatljive genetske faktore koji stoje iza porodičnog raka dojke, već i najavljuju mogućnost novih, ciljanih strategija lečenja koje bi na kraju mogle imati koristi od šireg spektra pacijenata, posebno onih iz nedovoljno zastupljenih grupa. “
Ova otkrića otvaraju potencijalne puteve za genetsko testiranje i razvoj ciljanih terapija, obećavajući značajan uticaj na upravljanje i lečenje raka dojke u različitim populacijama. Pored toga, nalazi mogu na kraju podržati stvaranje specijalizovanog panela za genetičko testiranje za ove grupe pacijenata, poboljšavajući rano otkrivanje i personalizovane planove lečenja kako istraživanje napreduje.
